理论上，竹制、木制筷子应该3~6个月更换一次，使用期限超过6个月以的筷子，可能会滋生黄曲霉素。黄曲霉毒素被世界卫生组织划定为1类致癌物，进入人体后，在肝脏中存留最多（是其他组织器官的5~15倍），因此对肝脏的损害也最大。

普通筷子在使用3-6个月后，筷子头的颜色会变深，即使仔细刷洗也依然如故，这是细菌长期堆积导致的颜色变化。就餐前应仔细观察一下筷子表面是否有斑点，特别是有没有霉斑。如果筷子上出现非竹子或木头本色的斑点，很可能已经发霉变质，就不能使用了。已经变色和出现霉斑的筷子，极有可能滋生了“黄曲霉素”，最好赶紧更换。筷子出现弯曲、变形，看上去很潮湿或闻起来有明显酸味，都是受污染或过期的标志，不可继续使用。

如果筷子在长期储存过程中卫生不达标，还会存留金黄色葡萄球菌、大肠杆菌等，抵抗力弱的人使用后可能导致感染性腹泻、呕吐等。最安全的方法是，筷子偏小的那头朝上，这样有利于水分蒸发。筷子横着放，不利于排水，更容易发霉。

另外，筷子筒要置于阴凉通风处，最好每周清洗消毒一次，筷子筒底部要有滤水功能，最好配个盘子接水。筷子筒要选择透风、不积水的，同时应经常清洗和消毒，并保持干燥。